Основное отличие - это дополнительный клапан. По сути, флейта французской и немецкой систем мало чем отличаются.

1. Есть различия во внешнем виде.
2. На флейте французской системы есть дополнительный клапан.  На французской системе клапан си будет идти вторым по счету, на немецкой - первым.
3. Клапан си бемоль на французской системе  первый, на немецкой  второй.
4. К тому же у французской системы есть ещё один клапан, который открывается, когда берётся соль-диез. Разница только в аппликатуре: у немецкой лапка соль-диеза обыкновенно нажата, у французской  наоборот.
5. И еще, у французской системы и только у нее есть ми-механика. Два соседних клапана (клапан соль и ближайший к нему со стороны нижнего колена) у флейт без ми-механики соединены, а с ми-механикой разделены, плюс ещё добавляется маленький рычажок. В результате с ми-механикой легче брать ми3 и она более стройная. Также ми-механика используется для нот 4-ой октавы.

Сегодня наибольшее распространение приобрели флейты французской системы. Их проще купить, выбор моделей значительно шире.Ознакомиться с каталогом французских флейт можно здесь